苯扎氯銨具有消毒、殺菌的功效與作用，也具有收斂止血的作用。

苯扎氯銨溶液是一種陽離子表面活性劑，具有廣譜的殺菌作用，可以殺滅細菌繁殖體、真菌、原蟲和部分病毒，在醫(yī)療上常用作殺菌消毒劑，可以用于皮膚黏膜的消毒，也可以用于湯商、滴蟲性陰道炎等疾病的治療。此外，該藥物也可以用于手術(shù)前的皮膚消毒、器械浸泡消毒以及陰道手術(shù)前的消毒