使用高頻電子垢處理儀之后，通過輔機的水，在強高頻電磁場的作用下，被極化、振蕩、撕裂， 部分水分子被電離成氫離子和氫氧根離子，氫氧根離子能使碳酸氫鈣發(fā)生水解反應(yīng)，生成氫氧化鈣、水和二氧化碳，氫氧化鈣在水中的溶解度較高（相對碳酸氫鈣而言），不會分解沉淀，這就是變頻電子除垢器的防垢原理。
     此外，高頻水垢處理儀還具有顯著的殺菌滅藻功能，強高頻電磁場破壞了它們的有機體，一般殺菌率在98%以上，滅藻率100%.